软件著作权申请中的文档，就是在软件设计过程中形成的文档。根据软件工程的要求，在软件设计制作过程中，会形成多个文档。整个过程一般会包括，用户需求报告、软件设计说明书、软件模块分析、软件模块设计和检测、软件整体统调和测试、生成用户操作手册等。

根据软件著作权登记的要求，这些过程中形成的对软件本身起说明性作用的文档，均可以作为软件著作权登记中的文档提交。一般会提交设计说明书或者操作手册（即用户手册）。所以，编写方法可以参见软件工程的相关教材。